Sebelum ke Borneo FC pada 2019, Javlon Guseynov berseragam FK AGMK Olmaliq.
Dia mengantarkan klub Liga Super Uzbekistan itu menjuarai Piala Liga edisi 2018.
Baca Juga: Lirik Lagu 'Spring Day' dari BTS Beserta Terjemahan Bahasa Indonesia
Di Borneo FC, Javlon telah mencatatkan 53 penampilan di Liga 1 selama tiga tahun (2019-2022).
Dia juga menyumbangkan tiga gol, masing-masing dua di 2019 dan satu di 2020.***